1、还原性上的区别。无损压缩就是可以完全还原的；有损压缩还原后不能和原来的文件一样，有一定的损耗的。
2、压缩率上的区别。无损压缩压缩率是受到数据统计冗余度的理论限制，一般为2:1到5:1；有损压缩利用了人类对图像或声波中的某些频率成分不敏感的特性，允许压缩过程中损失一定的信息，虽然不能完全恢复原始数据，但是所损失的部分对理解原始图像的影响缩小，却换来了大得多的压缩比最高可达200:1甚至更多。
3、压缩文件格式上的区别。mp3、divX、Xvid、jpeg、rm、rmvb、wma、wmv等格式都是有损压缩；无损压缩格式常用的有APE、FLAC、TAK、WavPack、TTA等。
4、压缩原理上的区别。有损压缩两种的基本机制：一种是有损变换编解码，首先对图像或者声音进行采样、切成小块、变换到一个新的空间、量化，然后对量化值进行熵编码。另外一种是预测编解码，先前的数据以及随后解码数据用来预测当前的声音采样或者图像帧，预测数据与实际数据之间的误差以及其它一些重现预测的信息进行量化与编码。无损压缩原理有行程编码、霍夫曼编码和算术编码等。
5、应用领域上的区别。有损压缩广泛应用于语音，图像和视频数据的压缩；无损压缩受压缩比的限制暂时只用于文本数据，程序和特殊应用场合的图像数据（如指纹图像，医学图像等）的压缩，但是无损压缩格式的前景无疑是光明的，随着时间的推移，限制无损格式的种种因素将逐渐被消除。
