1、幼苗期。芝麻幼苗期可少量施提苗肥，以尿素或稀释腐熟的动物粪便效果较好。不宜施氮肥过多，否则易成为高脚苗，使幼苗旺长。幼苗初期施肥时因芝麻根系浅应尽量浅施。苗期追肥宜开沟条施为好，如果土壤肥沃，基肥足，苗期也可不追肥。
2、花蕾期。此时是花芽分化形成时期，芝麻生长需要营养较多，此时应及时追肥，以氮肥为主，磷肥、钾肥为辅。根据土壤情况适量施加硼肥。追肥时间宜早不宜迟，应1-2次为宜，可亩施硫酸铵15-25公斤，或人畜尿粪1500-2000公斤，或尿素3-4公斤。
3、花期。芝麻进入花期会迅速生长，此时吸收的营养占整个生育期的70%-80%，因此必须进行追肥，此时芝麻侧根大量生长，根系发达，施肥以化肥较方便，也可施用腐熟的粪肥、饼肥等。可施过磷酸钙、硫酸铵各8公斤，可增产3成。时机宜早不宜迟，不可晚于盛花期，否则遇雨季阴雨天气易造成贪青晚熟，加重病害。芝麻追肥宜结合中耕，培土，浇水等时机进行。另在始花期和盛花期，可叶面喷施硼磷钾肥，也可明显提高产量。
