1、存储环境:蜂蜜要放在阴凉、干燥、通风的环境下保存，有条件时最好能放在冰箱的冷藏室中保存，同时蜂蜜在保存过程中一定要谨防发生串味，例如长期与大蒜保存在一起可能会使蜂蜜有一股大蒜味，另外蜂蜜绝对不能和有毒或有害的物质一起保存。
2、保存容器:蜂蜜的保存容器主要有玻璃瓶、陶瓷瓶、塑料瓶三种，其中长期保存时最好选择玻璃瓶或陶瓷瓶，而短期保存则可选用无毒且卫生的塑料瓶，值得注意的是蜂蜜不能用金属容器保存，原因是蜂蜜中的有机酸等酸性物质会和金属发生化学反应。
3、完全密:蜜蜂一定要严格密封保存，原因是蜂蜜有天然的润泽性且能吸收空气中的水分，水分进入蜂蜜中会破坏蜂蜜的抗菌能力，当水分含量达到一定值时蜂蜜就可能因微生物大量繁殖而变质，另外密封保存还能有效防止空气中的微生物进入蜂蜜中。
4、正确取用：蜜蜂保存过程中不建议频繁的取用，若必须取用也要用干燥且卫生的勺子，事实上蜂蜜提前变质往往都是不正确取用引起的，例如频繁用带水的勺子取用会破坏蜂蜜内部的渗透压和抗菌能力，最终整瓶蜂蜜都将因微生物大量繁殖而提前变质。
