养殖羊最忌讳的病菌和病毒主要包括以下几种：
1. 羊痘病毒（Sheep pox virus）：羊痘是一种高度传染性的病毒病，可导致发热、皮肤病变和呼吸系统症状，严重时可导致死亡。
2. 羊链球菌（Streptococcus species）：羊链球菌是一种常见的细菌病原体，引起羊的多种疾病，如脑膜炎、肺炎和乳腺炎等。
3. 羊钩虫（Haemonchus contortus）：羊钩虫是一种寄生虫，主要寄生在羊的胃部，会导致营养不良、贫血和腹泻等症状，严重时可造成死亡。
4. 羊肺热衣原体（Chlamydia psittaci）：羊肺热是一种由衣原体引起的呼吸系统疾病，可导致发热、呼吸困难和咳嗽等症状。
对于养殖羊，预防和控制这些病菌和病毒的传播非常重要，包括加强消毒、合理管理和定期做好兽医检查等措施。
