一、鱼鳃
鱼类都可以用鱼鳃进行呼吸。和陆生动物用肺呼吸不同，鱼儿的鱼鳃只能在水中才能发挥作用。它们的鳃盖下有鳃丝，鳃丝则密布着血管，当水流经过鳃部的时候，由于水和血液的流动方向相反，因此可以进行高效的气体交换，从而获得氧气，排出二氧化碳。
二、鱼鳔
除了鱼鳃外，还有一些鱼具有辅助呼吸器官，其中非洲肺鱼可以依靠鱼鳔呼吸。之所以叫肺鱼，是因为它们的鱼鳔构造特殊，类似肺部，中央腔的周围是小气室，小气室内又分为多个小气囊，可以储存氧气，让它们在离水后可以继续呼吸一段时间。
三、皮肤
弹涂鱼是一种生活在暖温性近岸的小型鱼类，一般栖息在沿岸的浅水区内，等到退潮的时候，它们可以在地面上活动觅食。这种鱼之所以离水也不会死，靠的就是皮肤和口腔黏膜进行呼吸，不过在晒干前，它们还是需要重回水中的。
四、肠道
在河流、湖泊以及水田的底层，生活着一种名为泥鳅的鱼类，它们昼伏夜出，具有很强的适应性，当水体缺氧的时候，这种鱼可以游到水面，将空气吞入到肠道中，从而进行呼吸。水池干涸前，只要潜入泥中，它们就可以继续生存。
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