杭椒：整体比较粗，椒果呈羊角形，果皮表面略皱，果顶渐尖且稍弯，青熟果呈淡绿色，老熟果呈红色，肉质较薄软，辣度不高，主要用来炒菜。
线椒：整体比较修长，椒果呈小羊角形，果面光滑，果顶渐尖且微弯，青熟果实呈绿色，老熟果实呈红色，肉质硬脆，无皮渣，香辣醇厚，辣味较重，适于干制。
一、外观区别
1、杭椒：通过杂交技术培育出来的辣椒品种。椒果呈羊角形，果长13cm左右，横径约1.4cm，平均单果重10g，整体比较粗，果面略皱，果顶渐尖且稍弯，细长而尖锐，青熟果呈淡绿色，老熟果呈红色。
2、线椒：最初是由四川某家育种公司研发的辣椒品种。椒果呈小羊角形，果长25-30cm，整体比较修长，果面光滑，果顶渐尖且微弯，青熟果实呈绿色，老熟果实呈红色。
二、口感区别
1、杭椒：果皮较薄且偏软，辣度不高，辣而不燥。
2、线椒：果皮相对硬一些，而且也比较脆，无皮渣，籽也非常少，辣味较重，香辣醇厚。与其他辣椒相比，线椒加热后几乎不变色，而且辣椒的本味非常浓郁。
三、食用方法区别
1、杭椒：由于辣度不高，因此非常适合江浙一带不怎么能吃辣的人群食用，主要用来炒菜。
2、线椒：辣度高于杭椒，香气十分突出，适于干制，多用来制作辣椒红油、火锅、串串底料等。
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