定义不同：生物肥一般是指通过微生物的生命活动让作物获得施肥效果的制品，水溶肥是指可以溶解且含有氮、磷、钾、氨基酸及微量元素等物质的复合型肥料。
营养成分不同：生物肥本身不含营养，但含有大量的有益菌，水溶肥按养分含量可分为大量元素、中量元素、微量元素水溶肥料。
用法不同：生物肥适合拌种，水溶肥适合根部冲施。
一、定义不同
1、生物肥
（1）狭义上的生物肥是指通过微生物的生命活动，使农作物得到特定肥料作用的制品。
（2）广义上的生物肥是指含有微生物及作物所需的各种营养元素的制品。
2、水溶肥
是指可以完全溶解在水中，且含有氮、磷、钾、钙、镁、海藻酸、腐植酸、氨基酸及微量元素等物质的复合型肥料。
二、营养成分不同
1、生物肥
自身没有养分，但富含有益菌。
2、水溶肥
按养分含量可分为大量元素、中量元素、微量元素水溶肥料，含氨基酸、腐植酸等养分的功能性水溶肥也常见于市场。
三、用法不同
1、生物肥
常被用作基肥、拌种、追肥。
2、水溶肥
主要用法为根部冲施、叶面喷施、膜下滴灌、山地喷灌等。
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